Candida guilliermondii and other species of candida misidentified as Candida famata: assessment by vitek 2, DNA sequencing analysis, and matrix-assisted laser desorption ionization-time of flight mass spectrometry in two global antifungal surveillance programs.

Candida famata (teleomorfo Debaryomyces hansenii) ha sido descrito como una levadura médicamente relevante, y esta especie se ha incluido en muchos sistemas de identificación comerciales que se utilizan actualmente en los laboratorios clínicos. Entre 53 cepas recolectadas durante los programas de vigilancia SENTRY y ARTEMIS y previamente identificados como C. famata (incluye todas las cepas presentadas con esta identificación) por una variedad de métodos comerciales (Vitek, MicroScan, API, y AuxaColor), métodos de secuenciación de ADN demostraron que 19 cepas fueron C. guilliermondii, 14 eran C. parapsilosis, 5 eran C. lusitaniae, 4 fueron C. albicans, y 3 eran C. tropicalis y cinco aislamientos pertenecían a otras especies de Candida (dos fermentati C. y uno cada uno C. intermedia , C. pelliculosa, y Pichia fabianni). Además, tres cepas mal identificados famata C. se identificaron correctamente como Kodomaea ohmeri, Debaryomyces nepalensis y Debaryomyces fabryi usando espaciador transcrito intergénica (ITS) y / o intergénicas espaciador (IGS) secuenciación. El sistema Vitek 2 identificó tres aislamientos con alta confianza para ser C. famata y otros 15 con baja confianza entre C. y C. guilliermondii famata o C. parapsilosis, mostrando solamente el 56,6% de acuerdo con los resultados de la secuenciación del ADN. Matrix asistida por láser de desorción ionización-tiempo de vuelo (MALDI-TOF) muestra resultados acuerdo 81,1% con la secuenciación del ADN. Una cepa de cada uno de C. metapsilosis, C. fermentati y C. intermedia demostró una puntuación baja de la identificación (<2,0) en el MALDI Biotyper. K. ohmeri, D. nepalensis, y D. fabryi identificaron mediante secuenciación de ADN en este estudio no se encontraban en la base de datos actual para el MALDI Biotyper. Estos resultados sugieren que la ocurrencia de C. famata en las infecciones por hongos es mucho menor que anteriormente apreciada y que los sistemas comerciales no producen identificaciones precisas a excepción de los instrumentos MALDI-TOF de reciente introducción.