Characterization of gene-environment interactions for colorectal cancer susceptibility loci.

Los estudios de asociación del genoma completo (GWAS) han identificado más de una docena de loci asociados con el cáncer colorrectal (CCR) de riesgo. Aquí, examinamos el potencial efecto de modificación entre los polimorfismos de un solo nucleótido (SNP) en 10 de estos loci y los factores de riesgo ambientales probables o establecidos para CRC en 7016 los casos de CCR y 9.723 controles de nueve estudios de cohortes y de casos y controles. Se utilizó el metanálisis de un eficiente estimador de Bayes empírica para detectar posibles interacciones multiplicativas entre cada uno de los SNPs [rs16892766 en 8q23.3 (eIF3h / UTP23), rs6983267 en 8q24 (MYC), rs10795668 en 10p14 (FLJ3802842), rs3802842 en 11q23 (LOC120376), rs4444235 en 14q22.2 (BMP4), rs4779584 en 15q13 (GREM1), rs9929218 en 16q22.1 (CDH1), rs4939827 en 18q21 (SMAD7), rs10411210 en 19q13.1 (RHPN2) y rs961253 en 20p12 0.3 (BMP2)] y seleccione los principales factores de riesgo CRC (sexo, índice de masa corporal, la talla, el tabaquismo, el consumo de alcohol aspirina / no esteroideo uso de fármacos antiinflamatorios, y la ingesta dietética de calcio, ácido fólico, la carne roja, carne procesada, verduras, frutas y fibra). La evidencia estadística más fuerte para una interacción entre genes y medio ambiente en todos los estudios fue para el consumo de verduras y rs16892766, localizado en el cromosoma 8q23.3, cerca de la eIF3h y UTP23 genes (P nominal (interacción) = 1,3 x 10 (-4); ajustado P = 0,02). La magnitud del efecto principal de la SNP aumentó con el aumento de los niveles de consumo de vegetales. No hay otras interacciones fueron estadísticamente significativos después de ajustar para comparaciones múltiples. En general, la asociación de más loci de susceptibilidad CRC identificado en GWAS inicial parece ser invariante a los otros factores de riesgo considerados; Sin embargo, nuestros resultados sugieren la posible modificación del efecto rs16892766 por el consumo de vegetales.