Multiple gene methylation of nonsmall cell lung cancers evaluated with 3-dimensional microarray.

ANTECEDENTES: la metilación del ADN aberrante de las islas CpG de los genes relacionados con el cáncer es una de las alteraciones más tempranas y más frecuente en el cáncer y puede ser útil para diagnosticar el cáncer o la evaluación de la enfermedad recurrente. MÉTODOS: En este estudio, un 3-dimensional (3-D), poliacrilamida ADN a base de gel de microarrays acoplada con reacción en cadena de enlazador-polimerasa (PCR) fue desarrollado para detectar la hipermetilación de islas CpG en múltiples genes a partir de un gran grupo de diferentes muestras . Los autores determinaron la frecuencia de metilación aberrante promotor de 15 genes en 28 primarias resecadas no pequeñas de cáncer de pulmón de células (NSCLC) y 12 correspondientes tejidos pulmonares no malignas. RESULTADOS: La frecuencia de metilación en las muestras de tumores se detectaron en el 18% de las muestras para el cáncer de mama 1 gen BRCA1, en 43% de las muestras para el inhibidor tisular de la metaloproteinasa 3 gen TIMP-3, en el 38% de las muestras para el dependiente de ciclina inhibidor de la cinasa 4A gen p16INK4a, en el 54% de las muestras para el 13 gen cadherina CDH13, en 50% de las muestras para la proteína-quinasa asociada a la muerte gen DAPK, en 11% de las muestras para la E-cadherina gen ECAD, en 25% de los muestras para la insulina como factor de crecimiento de la proteína de unión 7 gen IGFBP7, en 18% de las muestras para el dominio de la familia Ras asociación 1 gen RASSF1, en el 68% de las muestras para la poliposis coli adenomatosa gen APC, en el 7% de las muestras para la ciclina -quinasa dependiente de gen inhibidor de p15, en el 18% de las muestras para el gen de molécula de adhesión celular CD44, en 29% de las muestras para el ser humano Mut-L gen homólogo hMLH, en 32% de las muestras para la telomerasa transcriptasa inversa humana gen hTERT, en 64% de las muestras para la calcitonina relacionado con el gen polipéptido alfa gen CALCA, y en el 54% de las muestras para el gen de los receptores de estrógenos ER, sin embargo, la metilación no se observó en la mayoría de los tejidos no malignos correspondientes. Seis muestras de 28 tumores habían> 6 genes metilados, y 1 muestra tuvo 13 genes metilados. La metilación de estos genes se correlacionó con algunas características de los pacientes clinicopatológicos. Conclusiones: Este estudio demostró que un 3-D de microarrays podría ser utilizado para detectar la hipermetilación del ADN y proporciona una plataforma de alto rendimiento para el análisis de la hipermetilación del ADN.