DNA methylation of phosphatase and actin regulator 3 detects colorectal cancer in stool and complements FIT.

使用生物信息学为基础的战略，我们着手查明甲基化的基因，可以作为生物标记物的粪便中检测早期结直肠癌（CRC）的。此外，互补值到粪便免疫化学试验（FIT）进行评价。候选基因通过应用集群定位和启动子区域的计算分析，大肠腺瘤和癌基因芯片表达数据的选择。DNA甲基化测定通过定量甲基化特异性PCR在34正常结肠粘膜，71晚期腺瘤和64个大肠癌组织。表现为生物标志物全被粪便样本中共有193科目测试，其中包括19拥有先进的腺瘤和66 CRC。对于这些系列的很大比例，甲基化数据和GATA4 OSMR是可供比较。互补的价值，以适应从92人，包括44拥有先进的腺瘤或CRC检测粪便子样本。磷酸酶和肌动蛋白调节3（PHACTR3）被确定为一个新的高度甲基化的基因表示超过70倍增加的DNA甲基化水平的高级瘤变与正常结肠粘膜相比。在大便的训练集，PHACTR3甲基化显示，55％（95％CI：33-75），灵敏度为CRC和95％的特异性（95％CI：87-98）。在一个凳子验证组，灵敏度达到了66％（95％CI：50-79）的CRC和32％（95％CI：14-57），用于进展期腺瘤为100％（95％CI特异性：86-100 ）。加入PHACTR3甲基化FIT高达15％的CRC提高了灵敏度。PHACTR3是一个新的高甲基化基因与CRC粪便DNA检测有不错的表现，并具有互补的价值，以适应。