A meta-analysis of the bacterial and archaeal diversity observed in wetland soils.

Questo studio ha esaminato la diversità batterica e dell'archea da una gamma mondiale di zone umide suoli e sedimenti utilizzando un approccio meta-analisi. Tutti 16S rRNA sequenze geniche disponibili recuperati da zone umide in database pubblici sono stati recuperati. Nel mese di novembre 2012, per un totale di 12.677 batteri e 1747 sequenze archeali sono stati raccolti in GenBank. Tutte le sequenze batteriche sono stati assegnati in 6.383 unità tassonomiche operative (Otus 0,03), che rappresentano il 31 conosciuto phyla batterica, predominante con Proteobacteria (2791 OTU), Bacteroidetes (868 OTU), Acidobacteria (731 OTU), Firmicutes (540 OTU), e Actinobacteria (418 OTU). Il genere Flavobacterium (11,6% delle sequenze batteriche) sono stati i batteri dominano nelle zone umide, seguito da Gp1, Nitrosospira e Nitrosomonas. Sequenze archeali sono stati assegnati a 521 OTU da phyla Euryarchaeota e Crenarchaeota. I generi archeali predominavano erano Fervidicoccus e Methanosaeta. Analisi Rarefazione ha indicato che circa il 40% dei batteri e l'83% della diversità archeali in suoli delle zone umide e nei sedimenti sono stati presentati. I nostri risultati devono essere significativi per ben comprendere, la diversità microbica coinvolta nelle zone umide in tutto il mondo.