Long non-coding RNA HOTAIR, a driver of malignancy, predicts negative prognosis and exhibits oncogenic activity in oesophageal squamous cell carcinoma.

BACKGROUND: HOX trascritto RNA antisenso (HOTAIR), che si esprime dal Homebox C gene (HOXC) locus, è in grado di organizzazione riprogrammazione della cromatina e promuovere le metastasi delle cellule tumorali e può simultaneamente legare il Polycomb repressivo complesso 2, che migliora H3K27 trimethylation, e il complesso LSD1-CoREST-REST, che è critica per H3K4 demetilazione. Clinicamente, la sovraespressione di HOTAIR è un potente predittore di progressione tumorale e la sopravvivenza complessiva in pazienti con diversi tipi di cancro. Il rapporto tra HOTAIR ed esofagea carcinoma a cellule squamose (ESCC), tuttavia, rimane poco chiaro. Abbiamo studiato il ruolo della HOTAIR nella patogenesi della ESCC. Metodi: Abbiamo usato quantitativa real-time PCR per determinare il livello di HOTAIR in linee cellulari ESCC e 100 campioni ESCC da pazienti; 56 adiacenti tessuti non neoplastici sono stati utilizzati come controlli. Abbiamo misurato l'effetto di HOTAIR atterramento e sovraespressione in linee cellulari ESCC utilizzando saggi di formazione colonia, saggi di crescita ancoraggio-indipendente, il saggio CCK-8, transwell migrazione e invasione saggi e saggi annessina-V vincolante. Abbiamo analizzato la crescita dei tumori xenotrapianto ESCC in topi nudi. Le variazioni di espressione genica e livelli di metilazione in linee cellulari ESCC sono stati analizzati utilizzando microarray di espressione genica e il saggio Infinium HumanMethylation450K BeadChip rispettivamente. Risultati: I livelli di HOTAIR sono stati aumentati in linee cellulari ESCC ei campioni dei pazienti rispetto ai controlli; i livelli di espressione correlati con lo stadio di malattia e tempo di sopravvivenza. L'atterramento di HOTAIR nelle linee cellulari KYSE510 e KYSE180 ESCC utilizzando RNA piccolo tornante (shRNAs) ha ridotto la capacità delle cellule di formare foci, migrare e invadere la matrice extracellulare nella cultura, la progressione del ciclo cellulare alterata, e ha aumentato la sensibilità del cellule alla apoptosi. L'atterramento HOTAIR ridotto le metastasi delle cellule tumorali in vivo, e tumori formate dalle cellule ESCC HOTAIR-tacere erano più piccole, sia in termini di dimensioni e peso, rispetto ai tumori e metastasi formati dalle cellule di controllo vettoriale shRNA in un modello murino di xenotrapianto. I risultati dello studio hanno mostrato che gene microarray HOTAIR riprogrammato il profilo di espressione genica di cellule ESCC, e l'analisi del gene ontology rivelato un arricchimento in geni che sono importanti per la tumorigenesi, come i geni coinvolti nella migrazione cellulare e la regolazione del ciclo cellulare. Confrontando i profili di espressione genica e metilazione del DNA analisi tra le cellule KYSE180 e KYSE180_HOTAIR ha rivelato che solo una piccola parte delle variazioni di metilazione sono stati correlati con i cambiamenti di espressione genica. CONCLUSIONE: HOX trascritto RNA antisenso è upregulated in linee cellulari ESCC e campioni, e promuove la proliferazione delle cellule ESCC e metastasi tumorali nei topi. L'atterramento di HOTAIR portato a significativi cambiamenti nell'espressione genica, e l'analisi dei dati suggerisce che la regolamentazione gene HOTAIR mediata ha un ruolo critico nella ESCC progressione ed è un bersaglio molecolare epigenetico romanzo per il trattamento di pazienti ESCC.